Tugas pokok Pengadilan Negeri Bojonegoro sebagai Pengadilan Tingkat Pertama adalah menerima, memeriksa, memutus dan menyelesaikan sengketa perkara di Tingkat Pertama sesuai dengan Peraturan Perundang-undangan yang berlaku.

Fungsi Pengadilan Negeri Bojonegoro untuk melaksanakan tugas pokok tersebut, maka Pengadilan Negeri Bojonegoro mempunyai fungsi antara lain sebagai berikut  :

• Fungsi mengadili (judicial power), yakni memeriksa dan mengadili perkara yang menjadi wewenang Pengadilan Negeri Tingkat Pertama di wilayah hukumnya.
• Fungsi Administrasi, yaitu menyelenggarakan administrasi umum, keuangan dan kepegawaian serta lainnya untuk mendukung pelaksanaan tugas pokok Teknis Peradilan dan Administrasi Peradilan.
• Fungsi pengelolaan barang milik/kekayaan negara yang menjadi tanggung jawabnya.
• Fungsi Pengawasan internal dalam pelaksanaan tugas-tugasnya.
• Fungsi penyampaian laporan hasil evaluasi, saran dan pertimbangan dibidang tugas dan fungsinya kepada Pengadilan Tinggi Surabaya.
• Fungsi pembinaan, yaitu memberikan pengarahan, bimbingan dan petunjuk kepada pegawai Pengadilan Negeri Bojonegoro, baik menyangkut teknis yustisial, administrasi peradilan maupun administrasi umum.